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生物化學(xué)與分子生物學(xué)/嘌呤核苷酸的合成代謝

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生物化學(xué)與分子生物學(xué)

生物化學(xué)與分子生物學(xué)目錄

一、嘌呤核苷酸的合成

體內(nèi)嘌呤核苷酸的合成有兩條途徑:①利用磷酸核糖氨基酸、一碳單位及CO2等簡單物質(zhì)為原料合成嘌呤核苷酸的過程,稱為從頭合成途徑(denovo synthesis),是體內(nèi)的主要合成途徑。②利用體內(nèi)游離嘌呤或嘌呤核苷,經(jīng)簡單反應(yīng)過程生成嘌呤核苷酸的過程,稱重新利用(或補救合成)途徑(saluagepathway)。在部分組織如腦、骨髓中只能通過此途徑合成核苷酸

(一)嘌呤核苷酸的從頭合成

早在1948年,Buchanan等采用同位素標記不同化合物喂養(yǎng)鴿子,并測定排出的尿酸中標記原子的位置的同位素示蹤技術(shù),證實合成嘌呤的前身物為:氨基酸(甘氨酸天門冬氨酸、和谷氨酰胺)、CO2和一碳單位(N10甲酰FH4,N、N10-甲炔FH4)(圖8-3)。

嘌呤環(huán)合成的原料來源


圖8-3 嘌呤環(huán)合成的原料來源

隨后,由Buchanan和Greenberg等進一步搞清了嘌呤核苷酸的合成過程。出人意料的是,體內(nèi)嘌呤核苷酸的合成并非先合成嘌呤堿基,然后再與核糖磷酸結(jié)合,而是在磷酸核糖的基礎(chǔ)上逐步合成嘌呤核苷酸。嘌呤核苷酸的從頭合成主要在胞液中進行,可分為兩個階段:首先合成次黃嘌呤核苷酸(inosine monophosphate IMP);然后通過不同途徑分別生成AMP和GMP。下面分步介紹嘌呤核苷酸的合成過程。

1.IMP的合成:IMP的合成包括11步反應(yīng):(圖8-4)

IMP的合成


圖8-4 IMP的合成

(1)5-磷酸核糖的活化:嘌呤核苷酸合成的起始物為α-D-核糖-5-磷酸,是磷酸戊糖途徑代謝產(chǎn)物。嘌呤核苷酸生物合成的第一步是由磷酸戊糖焦磷酸激酶(ribosephosphate pyrophosphohinase)催化,與ATP反應(yīng)生成5-磷酸核糖-α-焦磷酸(5-phosphorlbosylα-pyrophosphatePRPP)。此反應(yīng)中ATP的焦磷酸根直接轉(zhuǎn)移到5-磷酸核糖C1位上。PRPP同時也是嘧啶核苷酸組氨酸色氨酸合成前體。因此,磷酸戊糖焦磷酸激酶是多種生物合成過程的重要酶,此酶為一變構(gòu)酶,受多種代謝產(chǎn)物的變構(gòu)調(diào)節(jié)。如PPi和2,3-DPG為其變構(gòu)激活劑。ADP和GDP為變構(gòu)抑制劑

(2)獲得嘌呤的N9原子:由磷酸核糖酰胺轉(zhuǎn)移酶(amidophosphoribosyltransterase)催化,谷氨酰胺提供酰胺基取代PRPP的焦磷酸基團,形成β-5-磷酸核糖胺(β-5-phosphoribasylamine PRA)。此步反應(yīng)由焦磷酸的水解供能,是嘌呤合成的限速步驟。酰胺轉(zhuǎn)移酶為限速酶,受嘌呤核苷酸的反饋抑制。

(3)獲得嘌呤C4、C5和N7原子:由甘氨酰胺核苷酸合成酶(glycinamide ribotidesynthetase)催化甘氨酸與PRA縮合,生成甘氨酰胺核苷酸(glycinamide ribotide,GAR)。由ATP水解供能。此步反應(yīng)為可逆反應(yīng),是合成過程中唯一可同時獲得多個原子的反應(yīng)。

(4)獲得嘌呤C8原子:GAR的自由α-氨基甲酰化生甲酰甘氨酰胺核苷酸(formylglycinamide ribotideFGAR)。由N10-甲酰-FH4提供甲酰基。催化此反應(yīng)的酶為GAR甲酰轉(zhuǎn)移酶(GAr transtormylase)。

(5)獲得嘌呤的N3原子:第二個谷氨酰胺的酰胺基轉(zhuǎn)移到正在生成的嘌呤環(huán)上,生成甲酰甘氨脒核苷酸(formylglycinamidine ribotide,FGAM)。此反應(yīng)為耗能反應(yīng),由ATP水解生成ADP+Pi,供能。

(6)嘌呤咪唑環(huán)的形成:FGAM經(jīng)過耗能的分子內(nèi)重排,環(huán)化生成5-氨基咪唑核苷酸(5-aminoimidazole ribotide,AIR)。

(7)獲得嘌呤C6原子:C6原子由CO2提供,由AIR羧化酶(AIrcarboxylase)催化生成羧基氨基咪唑核苷酸(carboxyamino imidazoleribotide,CAIR)。

(8)獲得N1原子:由天門冬氨酸與AIR縮合反應(yīng),生成5-氨基咪唑-4-(N-琥珀酰胺)核苷酸(4-aminoimidazole-4-(N-succinylocarboxamide)ribotide,SACAIR)。此反應(yīng)與(3)步相似,由ATP水解供能。

(9)去除延胡索酸:SACAIR在SACAIR甲酰轉(zhuǎn)移酶催化下脫去延胡索酸生成5-氨基咪唑-4-甲酰胺核苷酸(5-aminoimidazole-4-carboxamideribotide,AICAR)。(8)、(9)兩步反應(yīng)與尿素循環(huán)精氨酸生成鳥氨酸的反應(yīng)相似。

(10)獲得C2:嘌呤環(huán)的最后一個C原子由N10-甲酰-FH4提供,由AICAR甲酰轉(zhuǎn)移酶催化AICAR甲酰化生成5-甲酰胺基咪唑-4-甲酰胺核苷酸(5-formaminoimidazole-4carboxyamideribotide,FAICAR)。

(11)環(huán)化生成IMP:FAICAR脫水環(huán)化生成 IMP。與反應(yīng)(6)相反,此環(huán)化反應(yīng)無需ATP供能。

2.由IMP生成AMP和GMP

上述反應(yīng)生成的IMP并不堆積在細胞內(nèi),而是迅速轉(zhuǎn)變?yōu)锳MP和GMP。AMP與IMP的差別僅是6位酮基被氨基取代(圖8-5)。此反應(yīng)由兩步反應(yīng)完成。(1)天門冬氨酸的氨基與IMP相連生成腺苷酸琥珀酸(adenylosuccinate),由腺苷酸代琥珀酸合成酶催化,GTP水解供能。(2)在腺苷酸代琥珀酸裂解酶作用下脫去延胡索酸生成AMP。

GMP的生成也由二步反應(yīng)完成。(1)IMP由IMP脫氫酶催化,以NAD+為受氫體,氧化生成黃嘌呤核苷酸(xanthosinemonophosphate,XMP)。(2)谷氨酰胺提供酰胺基取代XMP中C2上的氧生成GMP,此反應(yīng)由GMP合成酶催化,由ATP水解供能(圖8-5)。

IMP分別生成AMP和GMP


圖8-5 IMP分別生成AMP和GMP

3.一磷酸核苷磷酸化生成二磷酸核苷和三磷核苷

要參與核酸的合成。一磷酸核苷必須先轉(zhuǎn)變?yōu)槎姿岷塑赵龠M一步轉(zhuǎn)變?yōu)槿姿岷塑铡6姿岷塑沼蓧A基特異的核苷一磷酸激酶(nucleoside monophosphate kinase)催化,由相應(yīng)一磷酸核苷生成。例如腺苷激酶催化AMP磷酸化生成ADP

Gra7anhh.jpg


二磷酸核苷激酶底物的堿基及戊糖(核糖或脫氧核糖)均無特異性。此酶催化反應(yīng)系通過“乒乓機制”,即底物NTP使酶分子的組氨酶殘基磷酸化,進而催化底物NDP的磷酸化。反應(yīng)△G≈0,為可逆反應(yīng)。

4.嘌呤核苷酸從頭合成的調(diào)節(jié)

從頭合成是體內(nèi)合成嘌呤核苷酸的主要途徑。但此過程要消耗氨基酸及ATP。機體對合成速度有著精細的調(diào)節(jié)。在大多數(shù)細胞中,分別調(diào)節(jié)IMP,ATP和GTP的合成,不僅調(diào)節(jié)嘌呤核苷酸的總量,而且使ATP和GTP的水平保持相對平衡。嘌呤核苷酸合成調(diào)節(jié)網(wǎng)可見圖8-6。

嘌呤合成的調(diào)節(jié)網(wǎng)


圖8-6 嘌呤合成的調(diào)節(jié)網(wǎng)

IMP途徑的調(diào)節(jié)主要在合成的前二步反應(yīng),即催化PRPP和PRA的生成。核糖磷酸焦磷酸激酶受ADP和GDP的反饋抑制。磷酸核糖酰胺轉(zhuǎn)移酶受到ATP、ADP、AMP及GTP、GDP、GMP的反饋抑制。ATP、ADP和AMP結(jié)合酶的一個抑制位點,而GTP、GDP和GMP結(jié)合另一抑制位點。因此,IMP的生成速率受腺嘌呤鳥嘌呤核苷酸的獨立和協(xié)同調(diào)節(jié)。此外,PRPP可變構(gòu)激活磷酸核糖酰胺轉(zhuǎn)移酶。

第二水平的調(diào)節(jié)作用于IMP向AMP和GMP轉(zhuǎn)變過程。GMP反饋抑制IMP向XMP轉(zhuǎn)變,AMP則反饋抑制IMP轉(zhuǎn)變?yōu)橄佘账岽晁幔瑥亩勒蛇^多AMP和GMP。此外,腺嘌呤和鳥嘌呤的合成是平衡。GTP加速IMP向AMP轉(zhuǎn)變,而ATP則可促進GMP的生成,這樣使腺嘌呤和鳥嘌呤核苷酸的水平保持相對平衡,以滿足核酸合成的需要。

(二)補救合成途徑:

大多數(shù)細胞更新其核酸(尤其是RNA)過程中,要分解核酸產(chǎn)生核苷和游離堿基。細胞利用游離堿基或核苷重新合成相應(yīng)核苷酸的過程稱為補救合成(saluage pathway)。與從頭合成不同,補救合成過程較簡單,消耗能量亦較少。由二種特異性不同的酶參與嘌呤核苷酸的補救合成。腺嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(Adenine phosphoribosyl transterase,APRT)催化PRPP與腺嘌呤合成AMP:

Gra7a4iv.jpg


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人體由嘌呤核苷的補救合成只能通過腺苷激酶催化,使腺嘌呤核苷生成腺嘌呤核苷酸。

Gra7akh2.jpg


嘌呤核苷酸補救合成是一種次要途徑。其生理意義一方面在于可以節(jié)省能量及減少氨基酸的消耗。另一方面對某些缺乏主要合成途徑的組織,如人的白細胞血小板、腦、骨髓、脾等,具有重要的生理意義。例如SesehNyhan綜合征是由于HGPRT的嚴重遺傳缺陷所致。此種疾病是一種性連鎖遺傳缺陷,見于男性。患者表現(xiàn)為尿酸增高及神經(jīng)異常。如腦發(fā)育不全智力低下、攻擊和破壞性行為、常咬傷自己的嘴唇、手和足趾,故亦稱自毀容貌癥。其尿酸增高較易解釋,由于HGPRT缺乏,使得分解產(chǎn)生的PRPP不能被利用而堆積,PRPP促進嘌呤的從頭合成,從而使嘌呤分解產(chǎn)物-尿酸增高。而神經(jīng)系統(tǒng)癥狀的機制尚不清楚。

32 核苷酸的化學(xué)結(jié)構(gòu) | 嘧啶核苷酸的合成代謝 32
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