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臨床生物化學(xué)/載脂蛋白的基因結(jié)構(gòu)及表型

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臨床生物化學(xué)

臨床生物化學(xué)目錄

(一)基因多態(tài)性概念

各種生物都能通過生殖產(chǎn)生子代,子代和親代之間,不論在形態(tài)構(gòu)造或生理功能的特點(diǎn)上都很相似,這種現(xiàn)象稱為遺傳(heredity)。但是,親代和子代之間,子代的各個(gè)體之間不會(huì)完全相同,總會(huì)有所差異,這種現(xiàn)象叫變異(variation)。遺傳和變異是生命的特征。遺傳和變異的現(xiàn)象是多樣而復(fù)雜的,正因?yàn)槿绱耍艑?dǎo)致生物界的多種多樣性,生物體所具有的遺傳性狀稱為表型或表現(xiàn)型(phernotype)。生物體所具有的特異基因成分稱為基因型(genotype)。表型是基因型與環(huán)境因素相互作用的結(jié)果。遺傳物質(zhì)是相對(duì)穩(wěn)定的,但是又是可變的,遺傳物質(zhì)的變化以及由其所引起表型的改變,稱為突變(mutation)。遺傳物質(zhì)突變包括染色體畸變基因突變。基因突變是染色體中某一點(diǎn)上發(fā)生化學(xué)改變,所以又稱為點(diǎn)突變(pointmutation)。基因結(jié)構(gòu)和遺傳表型的研究是深入了解脂蛋白代謝缺陷癥的分子生物學(xué)基礎(chǔ),逆向遺傳學(xué)方法(reversegeneticapproach)則使其有可能在蛋白質(zhì)水平系統(tǒng)地分析結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系。現(xiàn)已采用一個(gè)特定的cDNA探針基因文庫中篩選所需要的基因進(jìn)行cDNA克隆,測(cè)定其核苷酸序列,然后從核苷酸序列推斷蛋白質(zhì)氨基酸序列。目前,已分離出許多與動(dòng)脈粥樣硬化有關(guān)的脂蛋白的cDNA克隆,并將其蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的氨基酸排列順序和基因的核苷酸順序測(cè)出。現(xiàn)已查明,ApoAⅠ、AⅣ、E、B、CⅡ和(a)都存在著異構(gòu)體,也就是說存在著各種不同的表型或基因型,并可分別從蛋白質(zhì)水平和核酸水平進(jìn)行分型。現(xiàn)分別介紹幾種主要載脂蛋白的基因結(jié)構(gòu)。

(二)載脂蛋白基因結(jié)構(gòu)特點(diǎn)

人血漿中載脂蛋白的結(jié)構(gòu)及功能,經(jīng)過近十年的深入研究,已了解得較為清楚。大部分載脂蛋白的基因和cDNA都已得到分離和確定,其核苷酸順序也進(jìn)行了測(cè)定。除ApoAⅣ,B、(a)外,它們的共同特點(diǎn)是含有三個(gè)內(nèi)含子(intron)和四個(gè)外顯子(exon),其內(nèi)含子插入外顯子的位置大致相同,基本上按照生理功能的不同,將其加以分隔。第一個(gè)內(nèi)含子把5′-末端的非翻譯區(qū)和翻譯區(qū)分開;第二個(gè)內(nèi)含子把信號(hào)肽編碼(singnalpeptide)和功能蛋白編碼區(qū)分開;第三個(gè)內(nèi)含子則把原肽編碼區(qū)和成熟肽編碼區(qū)分開。這些基因的第一、二、三外顯子的核苷酸數(shù)量也相差無幾,第四個(gè)外顯子核苷酸數(shù)量不同而導(dǎo)致各種載脂蛋白基因長(zhǎng)度不同。從生物進(jìn)化角度考慮,上述載脂蛋白基因結(jié)構(gòu)相似性,提示可能來源于一個(gè)共同的祖先,即ApoCⅠ基因。ApoAⅣ與其他載脂蛋白基因結(jié)構(gòu)不同,它只含有三個(gè)外顯子。載脂蛋白基因結(jié)構(gòu)的另一特點(diǎn)是幾個(gè)基因相接很近,定位于同一染色體的一個(gè)位點(diǎn)上或附近,呈緊密連鎖狀態(tài)。如ApoAⅠ、CⅢ和AⅣ基因位于第11號(hào)染色體長(zhǎng)臂2區(qū),形成一個(gè)約15kb的基因簇。還有一個(gè)緊密連鎖的基因簇是ApoE、CⅠ和CⅡ基因,同位于第19號(hào)染色體長(zhǎng)臂3區(qū),見圖4-4。

ApoA-Ⅱ基因定位于第1號(hào)染色體長(zhǎng)臂2區(qū),ApoB基因定位于第2號(hào)染色體短臂2區(qū),Apo(a)基因定位于第6號(hào)染色體長(zhǎng)臂2區(qū)。

(三)載脂蛋白基因結(jié)構(gòu)

1.ApoAⅠApoAⅠ基因長(zhǎng)1863bp,含有三個(gè)內(nèi)含子,第一個(gè)內(nèi)含子位于5′端非翻譯區(qū);第二個(gè)內(nèi)含子位于翻譯區(qū)的AⅠ前肽區(qū)內(nèi);第三個(gè)內(nèi)含子插入翻譯成熟AⅠ第43氨基酸殘基處。ApoAⅠ基因含有四個(gè)外顯子,分布于ApoAⅠ基因的不同區(qū)域,ApoAⅠ基因與ApoCⅢ、AⅣ基因相連成簇,CⅢ基因居中,轉(zhuǎn)錄方向與AⅠ和AⅣ基因相反。位于AⅠ和CⅢ基因共同3′區(qū)的DNA序列,可能參與對(duì)AⅠ基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。

人載脂蛋白


圖4-4 人載脂蛋白AⅠ、AⅡ、AⅣ、B100

CⅡ、CⅢ和E基因結(jié)構(gòu)示意圖

粗線代表外顯子,粗線之間的細(xì)線代表內(nèi)含子,粗線上緣數(shù)字

代表該段核苷酸數(shù)目

2.ApoBApoB族位于2號(hào)染色體P23→Pter區(qū),是由非翻譯區(qū)、編碼區(qū)、TAA終止密碼子和一個(gè)3′端的非翻譯區(qū)組成。ApoB100基因全長(zhǎng)43kb,含29個(gè)外顯子和28個(gè)內(nèi)含子見圖4-4,其中第26和第29兩個(gè)外顯子特別長(zhǎng),分別含有7552和1905bp,外顯子2最短,僅39bp(從211-249)。內(nèi)含子則以第27個(gè)為最短(107bp)。人群中至少有14種不同的3′端高變異等位基因區(qū),75%的人群在此區(qū)是不均一的。

ApoB48和ApoB100除了在結(jié)構(gòu)上有關(guān)外,ApoB48的形成機(jī)制目前尚無完全一致的看法,主要認(rèn)為有合成ApoB48的基因存在。1987年被發(fā)現(xiàn)ApoB48是由ApoB100通過一種新的機(jī)制涉及到mRNA的編輯而產(chǎn)生的。在測(cè)定從人小腸基因庫分離的ApoBcDNA的序列時(shí)發(fā)現(xiàn),小腸ApoBcDNA的第6666個(gè)核苷酸為T,而從肝分離的ApoBcDNA克隆在此位置為C。將T替換C則6666處產(chǎn)生一終止編碼(TAA),TAA替換CAA編碼使ApoB100的2153位氨基酸應(yīng)為Gln,預(yù)示血漿中存在的ApoB48應(yīng)是相當(dāng)于ApoB100的2153氨基末端為Gln。這一預(yù)測(cè)后來得到實(shí)驗(yàn)證實(shí),并發(fā)現(xiàn)核苷酸上6666的替換C→T只發(fā)生在小腸的mRNA上,而不發(fā)生在小腸基因組(genomic)DNA上,因此這是轉(zhuǎn)錄以后的一種特殊形成的編輯小腸mRNA的結(jié)果.

3.ApoE人ApoE基因位于19號(hào)染色體長(zhǎng)臂3區(qū),含有四個(gè)外顯子和三個(gè)內(nèi)含子。

1975年首先觀察到ApoE的多態(tài)性,利用等電聚焦電泳和SDS-PAGE可以確認(rèn)ApoE的多態(tài)性。實(shí)驗(yàn)表明,ApoE有三種異構(gòu)體(isoform)即E2、E3和E4。有的人只含有一種主要異構(gòu)體即純合子,有的人可含二種主要異構(gòu)體為雜合子。由此可見,人群中可有六種不同的表現(xiàn)。根據(jù)ApoE表型提出ApoE基因模型認(rèn)為,ApoE的合成是由位于一個(gè)基因位點(diǎn)上的三個(gè)等位基因所控制,即E2、E3和E4,每一個(gè)等位基因?qū)?yīng)于一個(gè)主要異構(gòu)體,產(chǎn)生三種純合子(E2/2,E3/3,E4/4)和三種雜合子(E2/3,E2/4,E3/4)共六種常見表型,另外,還有極少見的異構(gòu)體。一般認(rèn)為,次要異構(gòu)體是由主要異構(gòu)體翻譯后,經(jīng)唾液酸糖化修飾后轉(zhuǎn)變而來。ApoE3/3型又稱野生型。ApoE的基因序列的112位和158位兩種氨基酸殘基即精氨酸(Arg)和半胱氨酸(Cys)的交換決定了異構(gòu)體的種類。ApoE4在這兩個(gè)位置上都是Arg;E2都是Cys;112和158位是Arg者為ApoE3異構(gòu)體。自然人群中,基因頻率(3)分布最高,ApoE3/3表型分布約70%,見圖4-5。

4.ApoC族ApoCⅡ基因有3347bp,含有4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子。ApoCⅡ的羧基末端氨基酸序列是激活脂蛋白脂肪酶的活性功能區(qū)域。ApoCⅢ基因含有3133bp,有4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子。

人ApoE三種主要異構(gòu)體的氨基酸殘基及基因密碼的改變位置


圖4-5 人ApoE三種主要異構(gòu)體的氨基酸殘基及基因密碼的改變位置

5.Apo(a)運(yùn)用cDNA探針進(jìn)行染色體定位研究時(shí)發(fā)現(xiàn),Apo(a)的基因位點(diǎn)在人第6號(hào)染色體長(zhǎng)臂2區(qū)6-7帶間,與血纖溶酶原(PLG)的基因位點(diǎn)有部分重疊。測(cè)定PLG基因跨距為525kb,由18個(gè)內(nèi)含子與19個(gè)外顯子組成,5個(gè)Kringle結(jié)構(gòu)由各自兩個(gè)外顯子編碼。Apo(a)cDNA分析表明,Apo(a)與PLG的基因有很多相似之處。

通過家系研究,目前已發(fā)現(xiàn)Apo(a)基因位點(diǎn)中至少有26個(gè)等位基因與多態(tài)性有關(guān)。這些等位基因至少表達(dá)有34種Apo(a)異構(gòu)體。

32 載脂蛋白組成與結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及生理功用 | 脂蛋白受體 32
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