水解酶類：碳-氮非肽（EC 3.5） 3.5.1：線性酰胺/ 酰胺水解酶 天冬酰胺酶 · 谷氨酰胺酶 · 脲酶 · 生物素酶 · 天冬氨酸酰酶 · 神經酰胺酶 · 天門冬酰胺氨基葡萄糖酶 · 脂肪酰胺水解酶 · 組蛋白脫乙酰酶（乙酰化酶） 3.5.2：環狀酰胺/ 酰胺水解酶 丙二酰脲酶 · β-內酰胺酶 3.5.3：線性脒/ 脲水解酶 精氨酸酶 · 鯡精胺酶 · 蛋白質-精氨酸脫亞氨酶 3.5.4：環狀脒/ 氨基水解酶 鳥嘌呤脫氨酶 · 腺苷脫氨酶 · AMP脫氨酶 · 肌苷單磷酸合酶 · DCMP脫氨酶 · GTP環水解酶I · 胞苷脫氨酶（AICDA、活化誘導的（胞苷）脫氨酶） 3.5.5：腈/ 氨基水解酶 腈水解酶 3.5.99：其他 核黃素酶 · 硫胺酶II EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22  · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9  · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13  · 4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5 · 6.1/2/3/4/5/6