主要組織相容性復合體
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即MHC，是指存在于脊椎動物某一染色體上的一組緊密連鎖的基因群，其編碼的產物(主要組織相容性抗原)與特異性免疫應答的發生密切相關。
小鼠MHC定位第17號染色體，人類MHC位于第6號染色體，MHC可分為三類基因群。
1. Ⅰ類基因：對于人類而言，包括3個基因位點，即A、B、C。其編碼產物為MHC Ⅰ 分子或抗原。
2. Ⅱ類基因：DP、DQ、DR三個亞區，其編碼的經典產物為MHC Ⅱ 類分子或抗原，尚有與內源性抗原處理有關的LMP、TAP。
3. Ⅲ類基因：編碼產物MHC Ⅲ 類分子或抗原
(一) MHC分子結構
1． MHC-I類分子
所有I類分子都包含有兩條不相連的多肽鏈：一條為MHC編碼的α鏈或稱重鏈，人類約44X103，小鼠約為47X103；另一條為獨立染色體基因編碼的β鏈(β2-微球蛋白)，人類和小鼠均為12X103。α鏈由一個約40X103的核心多肽鏈形成，N端連有一個(人類)或兩個(小鼠)寡糖，α鏈的3/4在胞膜外，包括氨基端和寡糖群，跨膜區為一疏水短片段，胞漿區為30個氨基酸殘基的羧基末端。β鏈與重鏈的胞膜外部分以非共價鍵結合，β鏈不與細胞直接相連。
2． MHC-II類分子
所有MHC-II類分子均由兩條以非共價鍵相連的多肽鏈組成，兩條鏈的整體結構相似，α鏈(33×103～34×103)，由于其廣泛的糖基化，因而略長于β鏈(29×103～32×103)。兩條多肽鏈均含有與N端相連的寡糖，胞外為氨基端，胞內為羧基端，每條鏈的2/3部分位于細胞外，兩條鏈由不同的MHC基因編碼，具有多態性(少數例外)。這兩類糖蛋白分子結構上具有共同特點，即表面都有一溝，第I類分子溝較淺，可以接受12-20個氨基酸組成的肽鏈；II類分子溝較深，可接受較長的肽鏈。
(二) MHC在免疫應答中作用
MHC-I和MHC-II除了結構有異外，它們的主要區別是在免疫應答中激活機制和效果不同。
病毒侵入細胞內后，利用細胞合成出蛋白質，這些蛋白質或一些片段穿過細胞膜，與膜上的MHC-I分子結合，形成MHC-抗原復合物，從而激活細胞毒性T細胞。Tc細胞一方面通過自我繁殖復制出大量相同的Tc細胞，一方面一部分分化為記憶細胞。這些Tc細胞與靶細胞結合，分泌穿孔素殺死被病毒感染或變異的細胞。
細菌、寄生蟲等體積較大，被巨噬細胞吞噬之后，一些抗原分子穿過細胞膜，夾在MHC-II分子溝中。巨噬細胞將抗原提呈給TH細胞,于是激活TH細胞。TH細胞一方面激活Tc細胞使發揮殺傷作用，一方面刺激表面與MHC-II-Ag結合的B細胞，使轉化為記憶細胞和漿細胞，大量分泌相應的抗體。
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